江苏大学医学院基础医学研究所成立于2008年7月，其前身为临床与基础医学研究中心。研究所以学科建设为依托，人才培养为根本，对内引导学科交叉与融合，对外加强交流与合作,努力构建转化医学研究的开放和共享平台。研究所致力于建成基础医学创新研究基地、高级医学人才培养基地和生物医药高科技产品的转化基地。
研究所围绕“健康中国”战略，以“立德树人”为根本任务，积极推进新医科建设，汇聚了一批年富力强的科研骨干，包括江苏特聘教授、省“333高层次人才”、省“六大人才高峰”等。现有研究人员63人，其中教授10名，副教授32名。研究领域涉及：（1）生殖免疫与肿瘤代谢；（2）细胞遗传与发育生物学；（3）病原致病因子及致病分子机制；（4）肿瘤病理与生物治疗。
近5年来，研究所共承担国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目等国家及省、部级研究课题50余项，获批研究经费2000多万元；在Nature nanotechnology、Cancer Cell、Advanced Materials、Mol Cancer、Biomaterials等期刊上发表论文300余篇。研究所重视以临床医学需求为导向，注重引导成果转化，形成一批具有自主知识产权的专利和产品。
研究所现拥有膜片钳系统、高分辨荧光显微镜、高效液相色谱仪、流式细胞仪、AKTA色谱系统、实时荧光定量PCR仪、全波段酶标仪、超高速冷冻离心机、凝胶成像系统、LEICA石蜡切片与冰冻切片机等大型仪器设备，能够从事基础医学多个领域、不同层次的高水平科学研究。
